Pri detoksikaciji od teških metala mogu se pojaviti prateće reakcije koje se često nazivaju „reakcijama detoksikacije" ili „Herxheimerova reakcija". Kada se vezani teški metali i drugi otrovi oslobode iz tkiva i dospiju u krvotok, to može privremeno opteretiti tijelo prije nego što se te tvari izluče.
Česti simptomi mogu biti glavobolja, umor, probavne tegobe, kožne nepravilnosti ili privremeno pogoršanje već postojećih tegoba. Te se reakcije u pravilu mogu smatrati znakom da je proces detoksikacije u tijeku. Međutim, važno je da ti simptomi ne postanu previše intenzivni i da ne preopterete tijelo.
Kako bi se nuspojave svele na minimum, ključan je postupan i blag pristup. Počni s niskim dozama sredstava za detoksikaciju i povećavaj ih polako. Pazi na dovoljan unos tekućine kako bi podržao izlučivanje te se pobrinuj za dovoljno odmora i sna. Prehrana s prevladavajućim bazičnim namirnicama i podrška organima za izlučivanje (jetri, bubrezima, crijevima) također su iznimno važni.