Jetra i crijeva usko su povezani putem krvotoka – govorimo o takozvanoj 'osi crijevo-jetra'. Sve hranjive tvari, ali i štetne tvari koje se iz crijeva apsorbiraju u krv, dolaze putem portalne vene izravno do jetre. Jetra ovdje funkcionira kao svojevrsna filtarska postaja koja pristigle tvari provjerava, koristi, pohranjuje ili detoksificira, prije nego što budu proslijeđene u veliki krvni optok. Zdrava crijevna barijera pritom je od presudne važnosti.
Ako je crijevna barijera narušena – primjerice zbog neuravnotežene prehrane, stresa ili infekcija (stanje koje se naziva i 'propusno crijevo' ili 'leaky gut') – neželjene tvari poput bakterijskih sastojaka (endotoksina) mogu u povećanoj mjeri dospjeti u portalnu venu. To dovodi do stalnog aktiviranja imunološkog sustava u jetri i može pokrenuti kronične upalne procese. Takvo trajno opterećenje može oštetiti jetru te pridonijeti nastanku masne jetre ili drugih bolesti jetre.
S druge strane, i jetra utječe na zdravlje crijeva. Žuč koju jetra proizvodi nije važna samo za probavu masti, nego ima i antimikrobijalno djelovanje te pomaže u regulaciji ravnoteže crijevnih bakterija. Zdrava jetra i dovoljan protok žuči dakle pridonose zdravoj crijevnoj flori. Briga o crijevima putem prehrane bogate prehrambenim vlaknima i probioticima uvijek je ujedno i briga za jetru – i obrnuto.